アララト山中にて“ノアの方舟”発見の報を受け発掘基地に飛んだ優に、米軍“機械化小隊（マシンナーズプラトゥーン）”の隊員らが襲いかかる。
苦戦するも“スプリガン”ジャン・ジャックモンドの助力を受け迎え撃つ優。
しかし、悪魔の力を持つ男・マクドガル大佐による追撃を受けて基地は陥落、方舟を開く“鍵”を奪われ、内部への侵入を許してしまう。